Skip to content

Commit

Permalink
demo expected clusters and summary for new exponentials scoring
Browse files Browse the repository at this point in the history
  • Loading branch information
@AdamDS
AdamDS committed Sep 28, 2017
1 parent ef386d1 commit 82d336c
Show file tree
Hide file tree
Showing 3 changed files with 75 additions and 60 deletions.
112 changes: 64 additions & 48 deletions Demo/Expected/randCharged.clusters
View file
Original file line number Diff line number Diff line change
@@ -1,49 +1,65 @@
Cluster Gene/Drug Mutation/Gene Degree_Connectivity Exponentials_Score Geodesic_From_Centroid Weight Chromosome Start Stop Reference Alternate Transcript Alternative_Transcripts
0.0 SMAD2 p.D300N 8 338.728486956113 8.973 -2 18 45374945 45374945 C T ENST00000262160 ENST00000356825:p.D270N|ENST00000402690:p.D300N|ENST00000586040:p.D270N|ENST00000591214:p.D270N
0.0 SMAD2 p.D304G 12 402.425886960928 5.579 -19 18 45374932 45374932 T C ENST00000262160 ENST00000356825:p.D274G|ENST00000402690:p.D304G|ENST00000586040:p.D274G|ENST00000591214:p.D274G
0.0 SMAD2 p.G301V 10 355.773866381305 8.554 4 18 45374941 45374941 C A ENST00000262160 ENST00000356825:p.G271V|ENST00000402690:p.G301V|ENST00000586040:p.G271V|ENST00000591214:p.G271V
0.0 SMAD2 p.P305L 12 343.773215651067 8.709 -10 18 45374929 45374929 G A ENST00000262160 ENST00000356825:p.P275L|ENST00000402690:p.P305L|ENST00000586040:p.P275L|ENST00000591214:p.P275L
0.0 SMAD2 p.P305Q 12 343.773215651067 8.709 -13 18 45374929 45374929 G T ENST00000262160 ENST00000356825:p.P275Q|ENST00000402690:p.P305Q|ENST00000586040:p.P275Q|ENST00000591214:p.P275Q
0.0 SMAD3 p.R268C 7 281.026897797364 7.954 -5 15 67473722 67473722 C T ENST00000327367 ENST00000439724:p.R224C|ENST00000537194:p.R73C|ENST00000540846:p.R163C|ENST00000558428:p.R73C|ENST00000558827:p.R73C|ENST00000558894:p.R163C
0.0 SMAD3 p.R268H 7 281.026897797364 7.954 5 15 67473723 67473723 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.R224H|ENST00000537194:p.R73H|ENST00000540846:p.R163H|ENST00000558428:p.R73H|ENST00000558827:p.R73H|ENST00000558894:p.R163H
0.0 SMAD4 p.D355G 14 436.173362801756 5.665 -4 18 48591901 48591901 A G ENST00000342988 ENST00000398417:p.D355G|ENST00000588745:p.D259G
0.0 SMAD4 p.D537E 15 487.411152390803 0 10 18 48604789 48604789 C A ENST00000342988 ENST00000398417:p.D537E|ENST00000588745:p.D441E
0.0 SMAD4 p.D537G 15 487.411152390803 0 10 18 48604788 48604788 A G ENST00000342988 ENST00000398417:p.D537G|ENST00000588745:p.D441G
0.0 SMAD4 p.D537V 15 487.411152390803 0 -6 18 48604788 48604788 A T ENST00000342988 ENST00000398417:p.D537V|ENST00000588745:p.D441V
0.0 SMAD4 p.D537Y 15 487.411152390803 0 14 18 48604787 48604787 G T ENST00000342988 ENST00000398417:p.D537Y|ENST00000588745:p.D441Y
0.0 SMAD4 p.L533R 13 394.489456789217 7.155 3 18 48604776 48604776 T G ENST00000342988 ENST00000398417:p.L533R|ENST00000588745:p.L437R
0.0 SMAD4 p.P356L 17 375.189579670895 9.057 -18 18 48591904 48591904 C T ENST00000342988 ENST00000398417:p.P356L|ENST00000588745:p.P260L
0.0 SMAD4 p.R361C 11 381.375300754182 8.514 0 18 48591918 48591918 C T ENST00000342988 ENST00000398417:p.R361C|ENST00000588745:p.R265C
0.0 SMAD4 p.R361H 11 381.375300754182 8.514 8 18 48591919 48591919 G A ENST00000342988 ENST00000398417:p.R361H|ENST00000588745:p.R265H
0.0 SMAD4 p.R361P 11 381.375300754182 8.514 -1 18 48591919 48591919 G C ENST00000342988 ENST00000398417:p.R361P|ENST00000588745:p.R265P
0.0 SMAD4 p.R361S 11 381.375300754182 8.514 -7 18 48591918 48591918 C A ENST00000342988 ENST00000398417:p.R361S|ENST00000588745:p.R265S
0.0 SMAD4 p.RFCLG361in_frame_del 11 381.375300754182 8.514 4 18 48591917 48591931 TCGCTTTTGTTTGGG - ENST00000342988 ENST00000398417:p.RFCLG361in_frame_del|ENST00000588745:p.RFCLG265in_frame_del
0.1 SMAD2 p.D450N 11 336.793326523117 9.491 -3 18 45368254 45368254 C T ENST00000262160 ENST00000356825:p.D420N|ENST00000402690:p.D450N|ENST00000586040:p.D420N
0.1 SMAD2 p.L446V 7 323.556587674178 8.997 14 18 45368266 45368266 G C ENST00000262160 ENST00000356825:p.L416V|ENST00000402690:p.L446V|ENST00000586040:p.L416V
0.1 SMAD3 p.Q405L 9 299.454636086796 6.928 -3 15 67482810 67482810 A T ENST00000327367 ENST00000439724:p.Q361L|ENST00000537194:p.Q210L|ENST00000540846:p.Q300L|ENST00000560424:p.S136C
0.1 SMAD4 p.S357P 10 337.598614761853 0 5 18 48591906 48591906 T C ENST00000342988 ENST00000398417:p.S357P|ENST00000588745:p.S261P
0.2 SMAD2 p.R321Q 6 241.348233788163 9.377 11 18 45374881 45374881 C T ENST00000262160 ENST00000356825:p.R291Q|ENST00000402690:p.R321Q|ENST00000586040:p.R291Q|ENST00000591214:p.R291Q
0.2 SMAD4 p.C499Y 3 282.363731326423 6.3805 6 18 48604674 48604674 G A ENST00000342988 ENST00000398417:p.C499Y|ENST00000588745:p.C403Y
0.2 SMAD4 p.D493N 7 274.709931091678 4.81 -1 18 48604655 48604655 G A ENST00000342988 ENST00000398417:p.D493N|ENST00000588745:p.D397N
0.2 SMAD4 p.R496H 5 287.442378105007 0 4 18 48604665 48604665 G A ENST00000342988 ENST00000398417:p.R496H|ENST00000588745:p.R400H
0.3 SMAD2 p.F311L 7 256.755478395373 0 8 18 45374910 45374910 G C ENST00000262160 ENST00000356825:p.F281L|ENST00000402690:p.F311L|ENST00000586040:p.F281L|ENST00000591214:p.F281L
0.3 SMAD2 p.N307H 5 247.382274489859 8.89166666666667 -10 18 45374924 45374924 T G ENST00000262160 ENST00000356825:p.N277H|ENST00000402690:p.N307H|ENST00000586040:p.N277H|ENST00000591214:p.N277H
0.3 SMAD2 p.S276L 4 203.396341822486 9.8825 -1 18 45375016 45375016 G A ENST00000262160 ENST00000356825:p.S246L|ENST00000402690:p.S276L|ENST00000586040:p.S246L|ENST00000591214:p.S246L
0.4 SMAD2 p.A323V 5 169.796907120626 9.49933333333333 -18 18 45374875 45374875 G A ENST00000262160 ENST00000356825:p.A293V|ENST00000402690:p.A323V|ENST00000586040:p.A293V|ENST00000591214:p.A293V
0.4 SMAD2 p.M327I 5 195.2429484263 5.49333333333333 -8 18 45374862 45374862 C G ENST00000262160 ENST00000356825:p.M297I|ENST00000402690:p.M327I|ENST00000586040:p.M297I|ENST00000591214:p.M297I
0.4 SMAD2 p.R330M 5 245.956956857437 0 14 18 45374854 45374854 C A ENST00000262160 ENST00000356825:p.R300M|ENST00000402690:p.R330M|ENST00000586040:p.R300M|ENST00000591214:p.R300M
0.5 SMAD2 p.G335E 3 245.484719634469 0 14 18 45372165 45372165 C T ENST00000262160 ENST00000356825:p.G305E|ENST00000402690:p.G335E|ENST00000586040:p.G305E|ENST00000591214:p.G305E
1.0 SMAD2 p.F356C 2 86.5021334237396 5.04433333333333 -7 18 45372102 45372102 A C ENST00000262160 ENST00000356825:p.F326C|ENST00000402690:p.F356C|ENST00000586040:p.F326C|ENST00000591214:p.F326C
1.0 SMAD2 p.G421W 3 122.347599932088 0 17 18 45371730 45371730 C A ENST00000262160 ENST00000356825:p.G391W|ENST00000402690:p.G421W|ENST00000586040:p.G391W|ENST00000591214:p.G391W
1.0 SMAD2 p.R427Q 2 93.0395595338417 7.85733333333333 9 18 45371711 45371711 C T ENST00000262160 ENST00000356825:p.R397Q|ENST00000402690:p.R427Q|ENST00000586040:p.R397Q|ENST00000591214:p.R397Q
2.0 SMAD2 p.Q407E 2 20.7335044391226 8.963 -18 18 45371772 45371772 G C ENST00000262160 ENST00000356825:p.Q377E|ENST00000402690:p.Q407E|ENST00000586040:p.Q377E|ENST00000591214:p.Q377E
2.0 SMAD2 p.S397F 3 35.737059929509 0 -8 18 45371801 45371801 G A ENST00000262160 ENST00000356825:p.S367F|ENST00000402690:p.S397F|ENST00000586040:p.S367F|ENST00000591214:p.S367F
2.0 SMAD2 p.V398A 2 35.0003504411155 4.17866666666667 -6 18 45371798 45371798 A G ENST00000262160 ENST00000356825:p.V368A|ENST00000402690:p.V398A|ENST00000586040:p.V368A|ENST00000591214:p.V368A
3.0 SMAD3 p.Q23R 2 28.1513258239721 8.746 -8 15 67358560 67358560 A G ENST00000327367 -
3.0 SMAD3 p.Q26H 2 29.0877401831856 0 0 15 67358570 67358570 G T ENST00000327367
4.0 SMAD3 p.L91P 2 42.6291540036077 8.391 -5 15 67457298 67457298 T C ENST00000327367 ENST00000439724:p.L47P|ENST00000559092:p.C73R
4.0 SMAD3 p.R93Q 2 59.9875818534749 0 10 15 67457304 67457304 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.R49Q|ENST00000559092:p.D75N
6.0 SMAD3 p.R420H 3 33.4394332743089 7.11 -15 15 67482855 67482855 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.R376H|ENST00000537194:p.R225H|ENST00000540846:p.R315H|ENST00000560424:p.A151T
6.0 SMAD3 p.S416F 3 38.8221107113789 6.321 -7 15 67482843 67482843 C T ENST00000327367 ENST00000439724:p.S372F|ENST00000537194:p.S221F|ENST00000540846:p.S311F|ENST00000560424:p.P147S
6.0 SMAD3 p.S418I 3 42.9942398011554 0 -1 15 67482849 67482849 G T ENST00000327367 ENST00000439724:p.S374I|ENST00000537194:p.S223I|ENST00000540846:p.S313I|ENST00000560424:p.A149S
6.0 SMAD3 p.S418N 3 42.9942398011554 0 -19 15 67482849 67482849 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.S374N|ENST00000537194:p.S223N|ENST00000540846:p.S313N|ENST00000560424:p.A149T
0.0 SMAD4 p.A327V 3 36.7260484679753 7.319 -3 18 48591817 48591817 C T ENST00000342988 ENST00000398417:p.A327V|ENST00000588745:p.A231V
0.0 SMAD4 p.K519N 3 35.6307020418153 7.3605 -5 18 48604735 48604735 A C ENST00000342988 ENST00000398417:p.K519N|ENST00000588745:p.K423N
0.0 SMAD4 p.S504R 4 64.1933251350011 6.4724 14 18 48604690 48604690 T A ENST00000342988 ENST00000398417:p.S504R|ENST00000588745:p.S408R
0.0 SMAD4 p.W524C 4 68.6625582167674 0 18 18 48604750 48604750 G T ENST00000342988 ENST00000398417:p.W524C|ENST00000588745:p.W428C
0.1 SMAD2 p.D304G 12 -47.8894965638324 3.906 -19 18 45374932 45374932 T C ENST00000262160 ENST00000356825:p.D274G|ENST00000402690:p.D304G|ENST00000586040:p.D274G|ENST00000591214:p.D274G
0.1 SMAD2 p.D450N 11 -42.1780177356515 8.524 -3 18 45368254 45368254 C T ENST00000262160 ENST00000356825:p.D420N|ENST00000402690:p.D450N|ENST00000586040:p.D420N
0.1 SMAD2 p.F311L 7 -13.981382501056 9.696 8 18 45374910 45374910 G C ENST00000262160 ENST00000356825:p.F281L|ENST00000402690:p.F311L|ENST00000586040:p.F281L|ENST00000591214:p.F281L
0.1 SMAD2 p.L442V 5 -63.4403534069303 9.803 -18 18 45368278 45368278 G C ENST00000262160 ENST00000356825:p.L412V|ENST00000402690:p.L442V|ENST00000586040:p.L412V
0.1 SMAD2 p.N307H 5 -43.0732130870616 7.03833333333333 -10 18 45374924 45374924 T G ENST00000262160 ENST00000356825:p.N277H|ENST00000402690:p.N307H|ENST00000586040:p.N277H|ENST00000591214:p.N277H
0.1 SMAD2 p.P305L 12 -64.2681911667125 0 -10 18 45374929 45374929 G A ENST00000262160 ENST00000356825:p.P275L|ENST00000402690:p.P305L|ENST00000586040:p.P275L|ENST00000591214:p.P275L
0.1 SMAD2 p.P305Q 12 -64.2681911667125 0 -13 18 45374929 45374929 G T ENST00000262160 ENST00000356825:p.P275Q|ENST00000402690:p.P305Q|ENST00000586040:p.P275Q|ENST00000591214:p.P275Q
0.1 SMAD4 p.C324R 4 -29.485111344403 9.626 2 18 48591807 48591807 T C ENST00000342988 ENST00000398417:p.C324R|ENST00000588745:p.C228R
0.1 SMAD4 p.D537E 15 -0.856377173850252 8.709 10 18 48604789 48604789 C A ENST00000342988 ENST00000398417:p.D537E|ENST00000588745:p.D441E
0.1 SMAD4 p.D537G 15 -0.856377173850247 8.709 10 18 48604788 48604788 A G ENST00000342988 ENST00000398417:p.D537G|ENST00000588745:p.D441G
0.1 SMAD4 p.D537V 15 -0.856377173850247 8.709 -6 18 48604788 48604788 A T ENST00000342988 ENST00000398417:p.D537V|ENST00000588745:p.D441V
0.1 SMAD4 p.D537Y 15 -0.856377173850254 8.709 14 18 48604787 48604787 G T ENST00000342988 ENST00000398417:p.D537Y|ENST00000588745:p.D441Y
0.1 SMAD4 p.L533R 13 -32.0878567029177 6.17 3 18 48604776 48604776 T G ENST00000342988 ENST00000398417:p.L533R|ENST00000588745:p.L437R
0.1 SMAD4 p.R531Q 5 -26.2113254038746 9.525 2 18 48604770 48604770 G A ENST00000342988 ENST00000398417:p.R531Q|ENST00000588745:p.R435Q
0.10 SMAD4 p.E337K 3 32.8958611452297 0 18 18 48591846 48591846 G A ENST00000342988 ENST00000398417:p.E337K|ENST00000588745:p.E241K
0.2 SMAD3 p.G379A 5 -8.46678224379092 9.105 0 15 67479829 67479829 G C ENST00000327367 ENST00000439724:p.G335A|ENST00000537194:p.G184A|ENST00000540846:p.G274A|ENST00000560424:p.A110P
0.2 SMAD3 p.P393L 4 -62.1517354561416 0 -17 15 67482774 67482774 C T ENST00000327367 ENST00000439724:p.P349L|ENST00000537194:p.P198L|ENST00000540846:p.P288L|ENST00000560424:p.P124S
0.2 SMAD3 p.P393T 4 -62.1517354561416 0 -12 15 67482773 67482773 C A ENST00000327367 ENST00000439724:p.P349T|ENST00000537194:p.P198T|ENST00000540846:p.P288T
0.2 SMAD3 p.Y237C 5 -42.6133479698847 9.426 -4 15 67473630 67473630 A G ENST00000327367 ENST00000439724:p.Y193C|ENST00000537194:p.Y42C|ENST00000540846:p.Y132C|ENST00000558428:p.Y42C|ENST00000558827:p.Y42C|ENST00000558894:p.Y132C
0.3 SMAD4 p.A406T 3 54.9453119204942 0 18 18 48593465 48593465 G A ENST00000342988 ENST00000398417:p.A406T|ENST00000588745:p.A310T
0.3 SMAD4 p.K428T 3 19.3441378828405 6.0625 -13 18 48593532 48593532 A C ENST00000342988 ENST00000398417:p.K428T|ENST00000588745:p.K332T|ENST00000593223:p.K17T
0.4 SMAD3 p.A329S 4 54.1979641136135 0 18 15 67477178 67477178 G T ENST00000327367 ENST00000439724:p.A285S|ENST00000537194:p.A134S|ENST00000540846:p.A224S
0.4 SMAD3 p.A382V 4 41.3520981131527 8.538 17 15 67479838 67479838 C T ENST00000327367 ENST00000439724:p.A338V|ENST00000537194:p.A187V|ENST00000540846:p.A277V|ENST00000560424:p.R113W
0.4 SMAD3 p.C320Y 6 46.4494741804193 9.647 11 15 67477152 67477152 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.C276Y|ENST00000537194:p.C125Y|ENST00000540846:p.C215Y|ENST00000560424:p.V14I
0.4 SMAD3 p.V331I 5 15.0062713965926 6.472 -14 15 67477184 67477184 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.V287I|ENST00000537194:p.V136I|ENST00000540846:p.V226I
0.5 SMAD3 p.G325D 3 38.9722603111448 8.032 11 15 67477167 67477167 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.G281D|ENST00000537194:p.G130D|ENST00000540846:p.G220D|ENST00000560424:p.A19T
0.5 SMAD3 p.K341N 3 21.4051801815523 7.028 -5 15 67479716 67479716 G C ENST00000327367 ENST00000439724:p.K297N|ENST00000537194:p.K146N|ENST00000540846:p.K236N|ENST00000558894:p.K190N|ENST00000560424:p.R72T
0.5 SMAD3 p.R323H 4 44.8109450810817 0 12 15 67477161 67477161 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.R279H|ENST00000537194:p.R128H|ENST00000540846:p.R218H|ENST00000560424:p.A17T
0.6 SMAD2 p.L446V 7 -37.532145293078 5.867 14 18 45368266 45368266 G C ENST00000262160 ENST00000356825:p.L416V|ENST00000402690:p.L446V|ENST00000586040:p.L416V
0.6 SMAD2 p.S276L 4 -30.2615985160496 9.079 -1 18 45375016 45375016 G A ENST00000262160 ENST00000356825:p.S246L|ENST00000402690:p.S276L|ENST00000586040:p.S246L|ENST00000591214:p.S246L
0.6 SMAD3 p.Q405L 9 -23.4503814880017 6.388 -3 15 67482810 67482810 A T ENST00000327367 ENST00000439724:p.Q361L|ENST00000537194:p.Q210L|ENST00000540846:p.Q300L|ENST00000560424:p.S136C
0.6 SMAD4 p.D355G 14 -19.6471713856765 3.8926 -4 18 48591901 48591901 A G ENST00000342988 ENST00000398417:p.D355G|ENST00000588745:p.D259G
0.6 SMAD4 p.P356L 17 -41.4783667966697 0 -18 18 48591904 48591904 C T ENST00000342988 ENST00000398417:p.P356L|ENST00000588745:p.P260L
0.6 SMAD4 p.R361C 11 -9.00527306083115 8.254 0 18 48591918 48591918 C T ENST00000342988 ENST00000398417:p.R361C|ENST00000588745:p.R265C
0.6 SMAD4 p.R361H 11 -9.00527306083115 8.254 8 18 48591919 48591919 G A ENST00000342988 ENST00000398417:p.R361H|ENST00000588745:p.R265H
0.6 SMAD4 p.R361P 11 -9.00527306083115 8.254 -1 18 48591919 48591919 G C ENST00000342988 ENST00000398417:p.R361P|ENST00000588745:p.R265P
0.6 SMAD4 p.R361S 11 -9.00527306083115 8.254 -7 18 48591918 48591918 C A ENST00000342988 ENST00000398417:p.R361S|ENST00000588745:p.R265S
0.6 SMAD4 p.RFCLG361in_frame_del 11 -9.00527306083115 8.254 4 18 48591917 48591931 TCGCTTTTGTTTGGG - ENST00000342988 ENST00000398417:p.RFCLG361in_frame_del|ENST00000588745:p.RFCLG265in_frame_del
0.6 SMAD4 p.S357P 10 -21.3397961718428 3.9882 5 18 48591906 48591906 T C ENST00000342988 ENST00000398417:p.S357P|ENST00000588745:p.S261P
0.7 SMAD3 p.R243C 4 -29.8572498267316 9.117 -15 15 67473647 67473647 C T ENST00000327367 ENST00000439724:p.R199C|ENST00000537194:p.R48C|ENST00000540846:p.R138C|ENST00000558428:p.R48C|ENST00000558827:p.R48C|ENST00000558894:p.R138C
0.7 SMAD3 p.V244I 3 -39.1873245706077 0 -11 15 67473650 67473650 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.V200I|ENST00000537194:p.V49I|ENST00000540846:p.V139I|ENST00000558428:p.V49I|ENST00000558827:p.V49I|ENST00000558894:p.V139I
0.8 SMAD3 p.M255I 5 -32.9736908301433 7.115 -9 15 67473685 67473685 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.M211I|ENST00000537194:p.M60I|ENST00000540846:p.M150I|ENST00000558428:p.M60I|ENST00000558827:p.M60I|ENST00000558894:p.M150I
0.8 SMAD3 p.P253S 3 -37.0639435220432 0 -13 15 67473677 67473677 C T ENST00000327367 ENST00000439724:p.P209S|ENST00000537194:p.P58S|ENST00000540846:p.P148S|ENST00000558428:p.P58S|ENST00000558827:p.P58S|ENST00000558894:p.P148S
0.8 SMAD3 p.R295W 3 -30.7372818506292 9.413 -9 15 67477076 67477076 C T ENST00000327367 ENST00000439724:p.R251W|ENST00000537194:p.R100W|ENST00000540846:p.R190W|ENST00000558827:p.R100W
0.9 SMAD2 p.N320H 3 33.172658129688 0 12 18 45374885 45374885 T G ENST00000262160 ENST00000356825:p.N290H|ENST00000402690:p.N320H|ENST00000586040:p.N290H|ENST00000591214:p.N290H
0.9 SMAD2 p.R321Q 6 16.3191516789902 6.36766666666667 11 18 45374881 45374881 C T ENST00000262160 ENST00000356825:p.R291Q|ENST00000402690:p.R321Q|ENST00000586040:p.R291Q|ENST00000591214:p.R291Q
1.0 SMAD2 p.F356C 2 17.9687090174704 5.04433333333333 -7 18 45372102 45372102 A C ENST00000262160 ENST00000356825:p.F326C|ENST00000402690:p.F356C|ENST00000586040:p.F326C|ENST00000591214:p.F326C
1.0 SMAD2 p.G421W 3 40.2090154406201 0 17 18 45371730 45371730 C A ENST00000262160 ENST00000356825:p.G391W|ENST00000402690:p.G421W|ENST00000586040:p.G391W|ENST00000591214:p.G391W
1.0 SMAD2 p.R427Q 2 29.5092748920051 7.85733333333333 9 18 45371711 45371711 C T ENST00000262160 ENST00000356825:p.R397Q|ENST00000402690:p.R427Q|ENST00000586040:p.R397Q|ENST00000591214:p.R397Q
2.0 SMAD2 p.Q407E 2 -51.3193151870329 0 -18 18 45371772 45371772 G C ENST00000262160 ENST00000356825:p.Q377E|ENST00000402690:p.Q407E|ENST00000586040:p.Q377E|ENST00000591214:p.Q377E
2.0 SMAD2 p.S397F 3 -35.3342082631589 8.963 -8 18 45371801 45371801 G A ENST00000262160 ENST00000356825:p.S367F|ENST00000402690:p.S397F|ENST00000586040:p.S367F|ENST00000591214:p.S367F
2.1 SMAD2 p.V398A 2 -27.8535230977763 0 -6 18 45371798 45371798 A G ENST00000262160 ENST00000356825:p.V368A|ENST00000402690:p.V398A|ENST00000586040:p.V368A|ENST00000591214:p.V368A
3.0 SMAD3 p.Q23R 2 -11.9345975811302 0 -8 15 67358560 67358560 A G ENST00000327367
3.0 SMAD3 p.Q26H 2 -4.97707088196036 8.746 0 15 67358570 67358570 G T ENST00000327367 -
4.0 SMAD3 p.L91P 2 0.703984960627056 8.391 -5 15 67457298 67457298 T C ENST00000327367 ENST00000439724:p.L47P|ENST00000559092:p.C73R
4.0 SMAD3 p.R93Q 2 13.7130806876979 0 10 15 67457304 67457304 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.R49Q|ENST00000559092:p.D75N
6.0 SMAD3 p.R420H 3 -60.3363178215448 7.11 -15 15 67482855 67482855 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.R376H|ENST00000537194:p.R225H|ENST00000540846:p.R315H|ENST00000560424:p.A151T
6.0 SMAD3 p.S416F 3 -49.1832621727788 6.321 -7 15 67482843 67482843 C T ENST00000327367 ENST00000439724:p.S372F|ENST00000537194:p.S221F|ENST00000540846:p.S311F|ENST00000560424:p.P147S
6.0 SMAD3 p.S418I 3 -71.0556997046806 0 -1 15 67482849 67482849 G T ENST00000327367 ENST00000439724:p.S374I|ENST00000537194:p.S223I|ENST00000540846:p.S313I|ENST00000560424:p.A149S
6.0 SMAD3 p.S418N 3 -71.0556997046806 0 -19 15 67482849 67482849 G A ENST00000327367 ENST00000439724:p.S374N|ENST00000537194:p.S223N|ENST00000540846:p.S313N|ENST00000560424:p.A149T
Loading

0 comments on commit 82d336c

Please sign in to comment.